蒙医馆是医院重点发展的特色科室之一。集传统中医，蒙、藏、苗等民族特色医药，心身医学以及西医治疗为一体的高品质专业化肿瘤康复基地。
蒙医馆取中、蒙、藏、苗等民族医学精华，结合现代医学体系，**“五体消瘤，自疗法”。民族医疗特色馆，主要面对赣北地区及周边的省市，秉承“为人民服务，保障人民的身体健康”的理念，以追求人性化服务为特色，坚持“以患者满意为宗旨，以医疗质量为生命”的办馆方针，积极倡导绿色医疗、科技医疗，不断推进传统蒙医及中医药理念与现代医疗设施相结合，弘扬传播传统民族医疗特色文化。
蒙医馆环境民族医疗特色馆开展蒙医火针、温针、放血、蒙医震脑术、蒙医心身医学、蒙医熏蒸、蒙医整骨术、蒙医点穴反射疗法、蒙医推拿复位、蒙医头皮针、蒙医茶疗术、蒙医小儿脑瘫康复、蒙医铜罐、蒙医擀背疗法、蒙医策格疗法、锤震疗法、蒙医五疗药浴等200余项特色治疗技术。蒙药制剂中心生产270种10个剂型的蒙药，广泛应用于心脑血管、血液病、肺病、布病、肾病、风湿性关节炎、各类皮肤病、抑郁症、妇科、男女性功能障碍，前列腺疾病及各种西医疗效不佳的疑难杂症。疗效显著，有效避免和减少了滥用抗生素及激素治疗带来的副作用，临床上有266种疾病完全使用蒙医蒙药进行治疗。
民族医疗特色馆在注重发挥传统医学优势的同时，充分利用现代医学技术，在心脑血管疾病、脑外、普外、泌尿外、心胸外、心脏介入及血液透析等领域具备精湛的技术。